В 1962 году Чен со своей семьей переехал в Гон-Конг, затем в 1968 году в Феникс и в 1973 году в Ньюстон. Он собирался продолжать семейный бизнес, но в 16 лет пристрастился к ставкам на спортивные соревнования. В 21 год он бросил университет, где обучался управлению и менеджменту ресторанного бизнеса, чтобы переехать в Лас-Вегас и стать профессиональным игроком.

В 1987 и 1988 он становится победителем World Series of Poker. В 1989 ему не удалось выиграть третий браслет подряд. Он уступил только Филу Хельмуту, став вторым. Чен постоянно держит возле себя на столе «счастливый» апельсин, чтобы не потерять удачу в игре. После второй подряд победы на WSOP многие игроки стали приносить с собой фрукты, следу я примеру Чена. В 2005 году Джонни Чен стал первым игроком, которому удалось занять 10 призовыхWorld Series of Poker. В 2002 году он удостоился чести попасть в Холл Славы.

До 2006 года Чен выиграл около четырех миллионов долларов в WSOP турнирах. Он соревновался в $400,000 Poker Superstars Invitational Tournament, который проводился в Феврале 2005. Также он участвовал в World Poker Tour, в 2004 и 2005 участвовал в World Series of Poker Tournament of Champions и National Heads-Up Poker Championship. Джонни Чен принимал участие в Poker Superstars II, где умудрился обыграть 22 профессиональные суперзвезды покера и занять второе место, уступив только Филу Хельмуту.

Чен участвовал в 4 турнирах Poker After Dark, три из которых выиграл в 2007, и два в 2008, обыграв Криса Манимейкера, Фила Хельмута и Патрика Антониуса. Единственный раз, когда Джонни Чену не удалось обыграть Джо Хачема, был турнир Golden Men. Чен занял второе место.

Кроме покерной профессии Чен является владельцем фаст фуд ресторана в отеле Stratosphere в Лас Вегасе и работает консультантом в нескольких казино. В данный момент он участвует в GSN сериях High Stakes Tour. Статьи, посвященные Чену, регулярно появляются в журналах Card Player и ежемесячном издании Trader Monthly.В 2005 году он помог издать книгу о покере Play Poker Like Johnny Chan, в которой находятся инструкции по разным видам покера.

В Ноябре 2006 вышло продолжение его книги Million Dollar Hold’em: Winning Big in Limit Games, которая описывала стратегии Limit Hold’em покера. В 2007 году Джонни Чен создал свой покеррум Chanpoker.com